空间转录组:Split-FISH技术及其在复杂组织内的多重RNA成像

课程简介

本次报告中，来自Genome Institute of Singapore的Chen Kok Hao博士将针对空间转录组学这一热门研究领域进行详细介绍。2015年Chen Kok Hao博士在哈佛大学Zhuang Xiaowei课题组开发了细胞内原位多重RNA成像的方法(MERFISH)，文章发表在顶级杂志Science上(Science ,348, aaa6090 (2015))。为解决组织中RNA成像非特异性背景噪音，Chen Kok Hao博士将在本次报告中介绍他们课题组最新开发的新型Split-FISH技术(Nature Method, 2020)。

Split-FISH技术通过split探针的设计和优化，减少了杂交脱靶背景信号，大大降低了非透明化组织中的假阳性信号，实现更精确的RNA分析。通过量化单个细胞中317基因的分布和丰度，揭示了Split-FISH技术在各种小鼠组织中的有效性，并揭示了多种复杂组织中转录组空间调控方式。

Chen实验室使用了Andor背照式sCMOS相机Sona 4.2B-11对多种复杂组织进行成像，借助于此款相机的高灵敏，成像速度和市场上最大的成像视野的特性，完成了多重FISH和多种RNA共定位相关研究。

主讲人介绍

Chen Kok Hao 研究员

Genome institute of Singapore新加坡基因组研究所

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